作者：杨志芬，陈绮 （海南大学信息科学技术学院）

出处：计算机应用与软件 2016

关键词：Hadoop；HDFS；小文件；存储效率；数据预取

摘要：医疗旅游是目前兴起的一个新型产业,面对今后日益增长的巨大数据,有效数据的存储和用户的快速访问是急需解决的课题。Hadoop的出现满足了这一需求。但Hadoop并不适合用来处理大量的小文件,其HDFS(Hadoop distributed file system)采用主从架构,存储大量的小文件时,元数 ...

作者：闫庆华，陈绮 （海南大学信息科学技术学院）

出处：沈阳农业大学学报 2013

关键词：蛋白质结构预测；K均值聚类；关联规则

摘要：为了建立蛋白质一级结构与三维结构间的关联规则,以蛋白质数据库PDB为数据源,采用K均值聚类方法对蛋白质二级结构中α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲的疏水值、偶极矩、解离常数3种属性值序列进行分析。结果表明:80%的螺旋和85%的beta折叠都表现出了自身应有的规律,说明聚类分析方法在蛋白质三级结构预测研 ...

作者：高冶，陈绮 （海南大学信息科学技术学院　　海南海口　　（570228））

出处：计算机技术与发展 2013

关键词：蛋白质二级结构；蚁群聚类；特征对比

摘要：通过氨基酸序列来预测蛋白质功能与空间结构一直是生物信息学研究的重点之一.蛋白质二级结构是在一定的氨基酸残基的组成和排列顺序(即蛋白质一级结构)的基础上形成的,不同的氨基酸残基由于具有不同的理化特性,从而形成不同的蛋白质二级结构.文中以蛋白质数据库(PDB)为数据源建立了二级结构数据库,并选取疏水值、 ...

作者：陈绮，杨雄，傅兆敏，覃子珍 （海南大学信息科学技术学院;海南大学信息科学技术学院 海口;）

出处：计算机工程 2008

关键词：主成分分析；结构因子；小波变换；

摘要：为了比较和分析蛋白质结构,采用二阶矩进行蛋白质质量主成分分析,以此构建蛋白质统一坐标系,建立蛋白质空间结构因子,并利用小波变换建立蛋白质三维空间结构频谱。实验结果表明,同类蛋白质结构频谱在总体相同的情况下有相异,这些差异点可为蛋白质结构比较提供量化分析依据。

作者：南雨宏，陈绮 （海南大学信息科学技术学院）

出处：计算机技术与发展 2011

关键词：蛋白质二级结构；序列片段；散列辞典；α-螺旋；β-折叠

摘要：提出一种易于修改的蛋白质二级结构预测算法。以蛋白质数据银行中PDB文本数据作为数据源,提取所有蛋白质氨基酸序列并以此建立样本数据库,然后针对α-螺旋、β-折叠分别利用基于散列辞典的不同改进方法编程实现蛋白质二级结构序列片段预测,在预测过程中,随机抽取68 421个蛋白质中部分样本作为测试集,对未知序 ...

作者：罗林波，陈绮，吴清秀 （海南大学信息科学技术学院；海南软件职业技术学院）

出处：计算机技术与发展 2010

关键词：主题爬虫；爬行策略；垂直搜索引擎

摘要：主题爬虫是实现垂直搜索引擎的核心技术。介绍主题爬虫的两个重要爬行算法:基于网页内容评价的Shark-Search算法和基于网页链接关系的Hits算法,并分析了各自的优缺点,提出了一种新的主题爬行策略:将上述两种算法的优点结合起来即将基于网页内容评价和基于网页链接关系算法结合起来判断待下载url的优劣 ...

作者：罗林波，陈绮 （海南大学信息科学技术学院）

出处：计算机技术与发展 2010

关键词：特征提取；熵密度；完全信息集

摘要：组成蛋白质的基本单位是氨基酸,对于蛋白质分类预测问题,氨基酸序列特征提取方法是一个非常重要的因素。对基于氨基酸组成、位置的特征提取算法如熵密度、n阶耦联组成和基于氨基酸性质的特征提取方法如自相关函数、伪氨基酸组成等方法进行了阐述,并进行了简单评价。基于氨基酸组成的方法实现简单、计算量小,且对所有的氨 ...

作者：陈绮，耿国华，王长缨 （西北大学计算机系可视化研究所；西北大学计算机系可视化研究所；华南热带农业大学计算机系）

出处：计算机应用与软件 2006

关键词：生物信息学；结构比较；算法

摘要：生物信息学中的结构比较在后基因时代中地位重要,在过去的十几年间,以蛋白质为主的结构比较算法研究取得了重大的进步。从几个方面对部分较重要和新近出现的算法进行了分析:以VAST与DALI算法为代表,阐述了全局与局部结构比较的情况;讨论了利用数学记号进行结构比较的算法;并简评了生物大分子表面结构比较的研究 ...

作者：陈绮，杨雄，何亦宗，周海龙，冯思玲，黄向党，羊秋玲，覃子珍

关键词：蛋白质；一级结构；生物资源

摘要：该项目采用数据挖掘技术结合图形图像处理技术进行相关特征的分析并进行关联规则建立：利用基于散列辞典的不同改进方法编程实现蛋白质二级结构序列片段预测；以蛋白质数据库PDB为数据源，建立蛋白质α螺旋，β折叠和无规则卷曲等二级结构数据库，选取其疏水值，解离常数等特征，利用K均值聚类对二级结构进行分类，建立起 ...

作者：谭毓银，陈绮 （海南大学,信息科学技术学院）

出处：电脑知识与技术 2010

关键词：边缘检测；检测算子；评判标准

摘要：图像边缘检测是图像处理和模式识别领域研究的重要课题,在实际中有着重要的应用。该文对一些常用的图像边缘检测算子进行简单的介绍,并通过实验对各种算子进行比较,分析了这些算子在边缘检测的优缺点,对于具体工程应用中具有很好参考价值。