软件工程系成立于2004年初，现有学生人数700多人。目前开设软件技术（省级特色专业）、移动互联网应用技术（校企合作专业），智能产品开发三个专业，下设软件理论与基础、软件技术和实验与实训3个教研室、软件研发中心和信息处理中心5个二级教学研究机构。软件技术专业是海南省特色专业，《Web国际标准》和《计算机辅助工程绘图》是省级精品课程，“软件技术专业（web应用系统）教学团队”是海南省省级教学团队。2009年被评为“海南省教育系统先进集体”，软件工程系党总支2008年被评为省教育工委“先进基层党组织”。
软件工程系现有校内专兼职教师46名，其中教授4名，副教授12名，讲师25名，具有硕士及以上学位38名；双师素质教师36名，教师具有软件设计师、数据库系统工程师等职业资格证书9名，校外兼职、兼课教师17名，海南省“515人才工程”第一层次专家1名，3名教师担任了海南省高职教学指导委员会委员、海南省计算机学会会长等职务；还聘请了12位IT领域的一线专家担任客座教授、兼职教授。我系教师在公开刊物发表学术论文200余篇(其中核心刊物48篇、被SCI、EI、ISTP等国际权威刊物检索收录65篇)，出版教材（专著）14部，主持或参与课题60项，课题来源主要有国家自然科学基金、省自然科学基金、海南省“十一五”教育规划、省教育厅和企业横向课题等。